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摘要:
为了解冰菜(Mesembryanthemum crystallinum)叶片抗盐相关基因组学,利用Illumina Hi-seq TM2500高通量测序技术研究冰菜叶片在400 mmol L-1 NaCl胁迫下转录组基因的差异表达.结果表明,从400 mmol L-1 NaCl胁迫和对照的冰菜叶片中共获得13.01 Gb Clean data,Q30碱基均大于90.08%.共获得123个差异表达基因(DEGs),包括73个上调基因,50个下调基因,其中功能注释的基因有96个.根据Unigene库序列进行GO、COG和KEGG注释,筛选出8个与抗盐性相关差异表达基因,植物激素代谢相关基因,脱落酸8?-羟基化酶、吲哚-3-乙酰酸酰胺合成酶和茉莉酮酸酯ZIM结构域蛋白基因均下调表达,生长素响应蛋白、细胞分裂素合酶基因则上调表达,糖代谢相关基因棉子糖合成酶基因上调表达,质膜H+-ATPase基因上调表达,脱水蛋白基因下调表达.这为冰菜耐盐基因组学和分子生物学的研究奠定基础.
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文献信息
篇名 冰菜盐胁迫下的转录组分析
来源期刊 热带亚热带植物学报 学科
关键词 冰菜 盐胁迫 叶片 转录组 差异表达基因
年,卷(期) 2019,(3) 所属期刊栏目 植物生理与分子生物学
研究方向 页码范围 279-284
页数 6页 分类号
字数 4295字 语种 中文
DOI 10.11926/jtsb.3972
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 赖正锋 福建省农业科学院亚热带农业研究所 89 220 7.0 9.0
2 洪建基 福建省农业科学院亚热带农业研究所 96 314 10.0 13.0
3 姚运法 福建省农业科学院亚热带农业研究所 57 123 6.0 8.0
4 练冬梅 福建省农业科学院亚热带农业研究所 37 52 4.0 5.0
5 林碧珍 福建省农业科学院亚热带农业研究所 21 28 3.0 4.0
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冰菜
盐胁迫
叶片
转录组
差异表达基因
研究起点
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引文网络交叉学科
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期刊影响力
热带亚热带植物学报
双月刊
1005-3395
44-1374/Q
大16开
广州天河区兴科路723号中国科学院华南植物园
1992
chi
出版文献量(篇)
2032
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6
总被引数(次)
31320
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