冰菜盐胁迫下的转录组分析

• 作者: 姚运法 林碧珍 洪建基 练冬梅 赖正锋
• 来源期刊: 热带亚热带植物学报
• 关键词: 冰菜 盐胁迫 叶片 转录组 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 植物生理与分子生物学
• 页码范围: 279-284
• 页数: 6页
• 字数: 4295字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11926/jtsb.3972

摘要

为了解冰菜(Mesembryanthemum crystallinum)叶片抗盐相关基因组学,利用Illumina Hi-seq TM2500高通量测序技术研究冰菜叶片在400 mmol L-1 NaCl胁迫下转录组基因的差异表达.结果表明,从400 mmol L-1 NaCl胁迫和对照的冰菜叶片中共获得13.01 Gb Clean data,Q30碱基均大于90.08％.共获得123个差异表达基因(DEGs),包括73个上调基因,50个下调基因,其中功能注释的基因有96个.根据Unigene库序列进行GO、COG和KEGG注释,筛选出8个与抗盐性相关差异表达基因,植物激素代谢相关基因,脱落酸8?-羟基化酶、吲哚-3-乙酰酸酰胺合成酶和茉莉酮酸酯ZIM结构域蛋白基因均下调表达,生长素响应蛋白、细胞分裂素合酶基因则上调表达,糖代谢相关基因棉子糖合成酶基因上调表达,质膜H+-ATPase基因上调表达,脱水蛋白基因下调表达.这为冰菜耐盐基因组学和分子生物学的研究奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赖正锋	福建省农业科学院亚热带农业研究所	89	220	7.0	9.0
2	洪建基	福建省农业科学院亚热带农业研究所	96	314	10.0	13.0
3	姚运法	福建省农业科学院亚热带农业研究所	57	123	6.0	8.0
4	练冬梅	福建省农业科学院亚热带农业研究所	37	52	4.0	5.0
5	林碧珍	福建省农业科学院亚热带农业研究所	21	28	3.0	4.0