鼠伤寒沙门菌小RNA GcvB靶基因的预测与验证

• 作者: 刘丽娟 李晨 杨琦 杨阳 潘永 马光强
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 沙门菌 小RNA GcvB 转录组测序 靶基因
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 894-898
• 页数: 5页
• 分类号: R378.2|S852.612
• 字数: 2943字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2020.04.027

摘要

为筛选鼠伤寒沙门菌小RNA GcvB调控的靶基因,本研究通过TargetRNA2软件预测能与GcvB R1、R2和R3区产生作用的基因,将鼠伤寒沙门菌gcvB基因敲除株的转录组测序结果注释到KEGG数据库以及GO富集分析,并利用荧光定量PCR对预测的靶基因进行验证.TargetRNA2的预测结果显示,杂交能量最高的narY、yeak、trpB和STM2732基因均能够和小RNA GcvB产生至少7个连续的碱基互补,narY、yeaK和trpB基因分别与鼠伤寒沙门菌无氧呼吸、脯氨酸与tRNA的识别以及色氨酸的合成相关.荧光定量PCR检测结果显示,narY、yeaK、trpB和STM2732基因在gcvB基因敲除条件下转录水平分别上调3.4、9.8、12.1和18.37倍.以上结果表明,narY、yeaK、trpB和STM2732基因受小RNA GcvB的负调控且可能为直接负调控.本研究为进一步探明小RNA GcvB与靶基因相互作用、小RNA的调控机制以及沙门菌致病机制奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨琦	贵州大学动物科学学院	14	32	3.0	5.0
7	杨阳	贵州大学动物科学学院	18	23	3.0	4.0
11	潘永	贵州大学动物科学学院	4	0	0.0	0.0