RNA-Seq分析baeSR和acrB对鼠伤寒沙门菌相关毒力基因表达的影响

• 作者: 张瑞良 徐军 李琳 李锐 王文静 王瑞 赵霞 高海侠
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 医学
• 关键词: 鼠伤寒沙门菌 RNA-Seq baeSR acrB 荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2019,（11）
• 所属期刊栏目: 基础兽医
• 页码范围: 2318-2325
• 页数: 8页
• 分类号: R378.22
• 字数: 5084字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2019.11.016

摘要

本研究旨在探索baeSR和acrB基因缺失后对鼠伤寒沙门菌相关毒力基因表达的影响.采用RNA-Seq技术筛选鼠伤寒沙门菌体外诱导环丙沙星耐药株(CR)、acrB基因缺失株(CR△acrB)、baeSR和acrB基因双缺失株(CR△baeSR△acrB)的差异表达基因,对筛选的基因进行GO富集和KEGG通路富集分析,进一步探究差异表达基因的主要功能及涉及的生物过程,并选出7个差异显著基因进行荧光定量PCR验证.结果 表明CR△acrB与CR相比较,共筛选到1 320个差异表达基因(fold change的绝对值＞2,Q-value＜0.005),其中上调426个,下调894个;CRAbaeSRAacrB与CR相比较,共筛选到1 377个差异表达基因(fold change的绝对值≥2,Q-value＜0.005),其中上调405个,下调972个,两个比较组筛选到的毒力相关基因均主要富集在双组分系统、鞭毛组件、沙门菌感染和上皮细胞的细菌入侵等通路中.荧光定量PCR验证结果与RNA-Seq结果基本一致.本研究对baeSR和acrB基因在鼠伤寒沙门菌毒力中的作用进行了初步分析和探索,为进一步研究鼠伤寒沙门菌致病机制奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李琳	安徽农业大学动物科技学院	37	343	9.0	18.0
2	王瑞	安徽农业大学动物科技学院	42	100	7.0	8.0
3	赵霞	安徽农业大学动物科技学院	16	104	4.0	10.0
4	李锐	安徽农业大学动物科技学院	14	20	2.0	4.0
5	徐军	安徽农业大学动物科技学院	9	13	2.0	3.0
6	高海侠	安徽农业大学动物科技学院	5	1	1.0	1.0
7	王文静	安徽农业大学动物科技学院	12	19	2.0	4.0
8	张瑞良	安徽农业大学动物科技学院	11	17	2.0	4.0