SNP-STR遗传标记复合扩增体系的构建及法医学应用

• 作者: 周怡君 尉艺凡 张霁 曹悦岩 朱强 李茜 杨以文 王玉芳 王秋月 胡渝涵 舒潘寅 黄雨果
• 来源期刊: 法医学杂志
• 学科: 政治法律
• 关键词: 法医遗传学 多态性,单核苷酸 短串联重复 等位基因特异性聚合酶链反应 混合DNA
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 316-325
• 页数: 10页
• 分类号: DF795.2
• 字数: 6625字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12116/j.issn.1004-5619.2020.03.005

摘要

目的 筛选并构建与目前STR数据库兼容的SNP-STR遗传标记复合扩增体系,调查其在四川汉族群体中的遗传多态性,并探讨其在混合DNA样本分析中的应用价值.方法 以现有商业试剂盒中使用的STR遗传标记为基础,筛选与STR遗传标记相邻的SNP位点并组成SNP-STR遗传标记.运用SNP等位基因设计特异性引物,构建基于等位基因特异性扩增的SNP-STR遗传标记复合扩增体系.调查该体系在四川汉族群体的遗传多态性,并评价不同位点数目的体系对两个体混合DNA样本的检测效能.结果 筛选并构建了由13个SNP-STR遗传标记构成的等位基因特异性复合扩增体系.在四川汉族群体中,各位点杂合度为0.76～0.88,累积个体识别率达0.999999999999999968.在对两个体混合DNA的分析中:单位点扩增时,混合样本的混合比例达到1000:1时依然可以检测到少量成分所特有的分型;多位点复合扩增时,混合比例最大可达500:1;随着体系中位点数量的增加,对混合DNA中少量成分的检测效能降低.结论 SNP-STR遗传标记较STR具有更高的多态性,其构成的复合扩增体系对混合样本的分析效能优于传统的STR复合扩增体系.