沙棘3-磷酸甘油脱氢酶基因生物信息学及表达分析

• 作者: 丁健 刘景 张莞晨 杜维 阮成江 韩平
• 来源期刊: 分子植物育种
• 关键词: 沙棘(Hippophae L.) HrGPD1基因 生物信息学分析 基因表达分析
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 基因组学及功能基因
• 页码范围: 409-415
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13271/j.mpb.018.000409

摘要

沙棘果肉和种子组织中均富含生物活性油.3-磷酸甘油脱氢酶(GPD1)是促进油脂合成前体甘油-3-磷酸(G3P)合成的限速酶.本研究对沙棘HrGPD1基因进行生物信息学分析(氨基酸序列,保守域,亚细胞定位等),及其在沙棘不同组织(果肉和种子)中的表达情况.研究发现:HrGPD1开放阅读框为1 143 bp,编码380个氨基酸,无信号肽和跨膜结构域,存在多个磷酸化位点,定位于质体中,蛋白高级结构以αr-螺旋为主,该蛋白序列与桑、梅、烟草和拟南芥的GPD表现出较高的序列相似性.qRT-PCR分析发现,HrGPD1基因在沙棘品系‘新俄3号’成熟种子和果肉中的相对表达量分别为0.52和1.35,与二者的含油率高低规律相一致.这为进一步研究HrG PD1基因在沙棘生物活性油合成过程中的作用机理提供科学依据.