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甘蓝型矮秆直立株型油菜株高性状基因的初步定位
甘蓝型矮秆直立株型油菜株高性状基因的初步定位
作者:
张显强
张瑞茂
李盼
李超
罗京
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
甘蓝型矮秆油菜
株高基因
BSA-seq技术
摘要:
定位甘蓝型矮秆直立株型油菜的株高基因,解析矮秆性状的遗传规律,对油菜育种的产量具有重要意义.通过甘蓝型三系油菜(不育系5824ci×恢复系5771r)杂交,在F1中发现变异单株,命名“DW871”.经多代自交,从群体中选取纯合矮秆和对应纯合高秆杂交,从杂交后代分离群体中分别选取47个矮秆、47个高秆和10个纯合矮秆材料,分别构建基因池.利用BSA-seq简化基因组测序技术,以47个矮秆与47个高秆,10个纯合矮秆与47个高秆进行关联分析(BSA),从47个矮秆与47个高秆基因混合池间检测到差异SNP共121998个,非同义突变SNP共1582个,在ChrA10染色体上定位1个显著关联区域,区间长度6.39 Mb,合1405个候选基因;从10个纯合矮秆与47个高秆基因混合池间共获得1752011个SNP,非同义突变SNP共27723个,InDel 518420个,在ChrA03、ChrA04、ChrA06、ChrA07、ChrA10和ChrC03上定位共19个与性状相关的候选区域,区间长度5.35 Mb,合1143个候选基因.然而由于未达到理论阈值,这个区域很可能是假阳性区域,需要进一步验证.47个矮秆基因混池和10个纯矮秆基因混池在ChrA10染色体上定位的关联区域互相重合,重合区间为1.83 Mb.本研究在ChrA10染色体上定位1个与DW871株高性状显著关联区间,这一研究结果为精细定位甘蓝型矮秆直立株型油菜株高性状基因奠定了良好基础.
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GBS高密度遗传连锁图谱定位甘蓝型油菜粉色花性状
甘蓝型油菜
粉色花性状
遗传连锁图谱
QTL定位
内容分析
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文献信息
篇名
甘蓝型矮秆直立株型油菜株高性状基因的初步定位
来源期刊
植物遗传资源学报
学科
关键词
甘蓝型矮秆油菜
株高基因
BSA-seq技术
年,卷(期)
2020,(1)
所属期刊栏目
论文
研究方向
页码范围
83-93
页数
11页
分类号
字数
6263字
语种
中文
DOI
10.13430/j.cnki.jpgr.20190514001
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
李超
贵州师范大学生命科学学院
28
145
7.0
10.0
3
张瑞茂
贵州省农业科学院油菜研究所
6
7
2.0
2.0
4
张显强
贵州师范大学生命科学学院
14
3
1.0
1.0
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李盼
贵州师范大学生命科学学院
3
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罗京
贵州师范大学生命科学学院
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节点文献
甘蓝型矮秆油菜
株高基因
BSA-seq技术
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研究来源
研究分支
研究去脉
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期刊影响力
植物遗传资源学报
主办单位:
中国农业科学院作物科学研究所
中国农学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1672-1810
CN:
11-4996/S
开本:
大16开
出版地:
北京市中关村南大街12号
邮发代号:
82-643
创刊时间:
2000
语种:
chi
出版文献量(篇)
2803
总下载数(次)
3
总被引数(次)
34934
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