基于线粒体DNA D-Loop区分析我国沿海厚壳贻贝群体遗传结构

• 作者: 冯鉴童 姚亚荣 傅泽钦 郭亚红 叶莹莹
• 来源期刊: 浙江海洋大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 厚壳贻贝 线粒体DNA D-loop区 遗传多样性 遗传结构
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 页码范围: 229-236
• 页数: 8页
• 分类号: S917.4
• 语种: 中文

摘要

基于野生厚壳贻贝的线粒体DNA D-Loop区,对我国沿海6个群体(青岛、舟山、玉环、台山、平潭、厦门)的129个厚壳贻贝个体进行遗传多样性及遗传结构分析,获得1 113 bp的同源序列,共检测到31个变异位点,得到35个单倍型.A+T含量(64.2％)显著高于G+T含量(35.8％),具有明显的碱基组成偏倚性.结果显示出较高的遗传多样性水平,单倍型多样性(h)为0.853～0.912,核苷酸多样性为(π)为0.005 55～0.007 36.群体之间的FST值(-0.021 79～0.076 30)水平较低,差异几乎不显著;通过Nm值(3.026 54～32.429 74)发现,基因均质化现象明显,基因流导致种群间分化程度甚小.系统进化树显示舟山群体与其他种群有分化现象,但另外5个地区种群的分化程度不高,AMOVA结果显示种群分化都来自于种内,种群间几乎没有遗传分化.单倍型网络图显示6个群体的单倍型没有明显的单支分化.