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基于宏基因组测序的扶桑绵粉蚧内共生菌多样性研究
基于宏基因组测序的扶桑绵粉蚧内共生菌多样性研究
作者:
何成伟
白华菊
蓝翊文
钟勇
马福欢
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
扶桑绵粉蚧
内共生菌
宏基因组测序
生物信息学
入侵生物
摘要:
[目的]扶桑绵粉蚧是一种重要的入侵害虫,也被列为我国的检疫性有害生物.内共生菌的群落结构及与扶桑绵粉蚧关系的研究,将为研究扶桑绵粉蚧的入侵生物学和防治提供新的思路和参考.[方法]利用宏基因组测序技术对室内饲养扶桑绵粉蚧内共生菌的物种组成、丰度和多样性进行了研究.[结果]共鉴定获得29个门,47个纲,105个目,178个科,245个属,299个种.变形菌门、γ-变形菌纲、肠杆菌目、肠杆菌科、伯克氏菌属、Candidatus分别为各分类阶元的优势种群.共预测了36505个基因,其中77.27%的基因分布在200~499 nt的范围内.基因集KEGG注释表明,扶桑绵粉蚧内共生菌代谢相关基因最多,达384个,占49.48%;环境信息处理基因最少,仅8个,占1.03%;代谢相关基因最多的为氨基酸代谢基因,为64个,占28.19%.基因集COG注释表明,翻译、核糖体结构和生物发生的基因最多,其次为氨基酸转运和代谢基因,分别占27.64%和12.31%.[结论]初步确定了扶桑绵粉蚧内共生菌菌群的群落结构和优势菌群,并初步分析了这些内共生菌的功能基因情况,为进一步研究内共生菌与扶桑绵粉蚧之间的关系提供了基础,以期从内共生菌的角度为该虫的防控提供新的策略.
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入侵害虫
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扶桑绵粉蚧
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文献信息
篇名
基于宏基因组测序的扶桑绵粉蚧内共生菌多样性研究
来源期刊
生物安全学报
学科
关键词
扶桑绵粉蚧
内共生菌
宏基因组测序
生物信息学
入侵生物
年,卷(期)
2020,(4)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
273-278
页数
6页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.2095-1787.2020.04.008
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内共生菌
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生物信息学
入侵生物
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研究来源
研究分支
研究去脉
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相关学者/机构
期刊影响力
生物安全学报
主办单位:
中国植物保护学会
福建省昆虫学会
出版周期:
季刊
ISSN:
2095-1787
CN:
35-1307/Q
开本:
16开
出版地:
福建省福州市金山福建农林大学
邮发代号:
创刊时间:
1992
语种:
chi
出版文献量(篇)
584
总下载数(次)
2
总被引数(次)
2403
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