莱茵衣藻响应缺硫的环状RNA的预测与鉴定

• 作者: 候恺玥 娄素琳 曾志勇 李辉 胡章立
• 来源期刊: 深圳大学学报（理工版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 分子生物学 真核微藻 莱茵衣藻 非编码核糖核酸 环状核糖核酸 缺硫
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 学术快报
• 页码范围: 221-223
• 页数: 3页
• 分类号: Q173
• 字数: 1725字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1249.2020.03221

摘要

环状核糖核酸(circular ribonucleic acid,circular RNA或circRNA)是一类无5'帽子结构及3'poly A尾,以共价键连接形成闭合环形结构的非编码RNA分子,通过转录后调控的方式参与动植物细胞的众多代谢途径.莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii,C.reinhardtii)是一种重要的真核单细胞模式微藻,为探究其是否存在环状RNA,本研究通过RNA-Seq高通量测序分析正常与缺硫培养的C.reinhardtii RNA组学数据,首次预测获得218条环状RNA序列,通过对比缺硫处理前后莱茵衣藻环状RNA序列,获得8条差异表达的环状RNA序列(其中,5条为表达上调、3条为表达下调).本研究首次对单细胞真核微藻莱茵衣藻进行环状RNA的生物信息学预测,确认莱茵衣藻环状RNA响应缺硫胁迫,为下一步揭示莱茵衣藻环状RNA参与响应莱茵衣藻缺硫的作用机制奠定基础.