全外显子组测序研究卵巢早衰特异性变异关联的生物学过程

• 作者: 伯乐 占雷 吴志南 周安稳 宋晓雪 茅彩萍
• 来源期刊: 中华生殖与避孕杂志
• 关键词: 全外显子测序 卵巢早衰 功能富集 信号通路 蛋白互作
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 400-406
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.cn101441-20190522-00202

摘要

目的 研究卵巢早衰(POF)特异性变异关联的生物学过程.方法 通过对来自2个家系的3个POF患者和7个健康对照的全外显子组测序数据进行生物信息学分析.对筛选获得的POF特异性单核苷酸变异(SNVs)以及对应的基因进行生物学功能富集与蛋白互作分析.结果 262个疾病特异性变异对应基因显著富集在多个GO功能条目下,如在生物学过程集合中的嗜同性细胞黏附(P=1.28E-3)、细胞黏附(P=3.56E-3)、转录的正调节(P=9.41E-3)、消化道发育(P=0.011)、Notch信号通路(P=0.018)、钙离子跨膜转运(P=0.021)、细胞对氧气水平降低的反应(P=0.026)等,在细胞组分集合中的质膜(P=2.58E-4)、细胞前缘(P=0.014)、中心粒(P=0.016)、动力蛋白复合物(P=0.033)、突触后致密区(P=0.035),在分子功能集合中的转录因子活性(P=5.04E-3)、肌动蛋白结合(P-6.03E-3)、钙离子结合(P=0.008)、核小体组蛋白结合(P=0.039)、碳水化合物结合(P=0.048)等.其次262个基因显著富集在多个KEGG生物信号通路中,如背腹轴形成(P=4.09E-4)、甲状腺激素信号通路(P=0.017)、血管加压素调节的水重吸收(P=0.020)、Notch信号通路(P=0.025)、亨廷顿病(P=0.042).另外对262个基因编码的蛋白进行蛋白互作网络分析,结果显示MYC、FOXO1、CREBBP、NOTCH2及HES1等包含在互作网络中的核心基因组成的较强网络簇中.结论 POF特异性的遗传学变化可能通过导致卵巢发育生物学过程及卵巢发育相关的信号通路的活性改变,从而促进POF的发生.这些证据可以为POF的遗传发病机制进一步研究提供坚实的理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	茅彩萍	苏州大学附属第一医院生殖医学中心	53	403	10.0	18.0
2	吴志南	苏州大学附属第一医院生殖医学中心	23	57	5.0	7.0
3	伯乐	苏州大学附属第一医院生殖医学中心	9	4	1.0	1.0
4	宋晓雪	苏州大学附属第一医院生殖医学中心	6	2	1.0	1.0
5	周安稳	苏州大学附属第一医院生殖医学中心	10	6	2.0	2.0
6	占雷	苏州大学附属第一医院生殖医学中心	4	1	1.0	1.0