基于生物信息学分析筛选人类胃癌预后生物标志物

• 作者: 李琳君 林陈胜 陈毅斌
• 来源期刊: 福建师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 胃癌 生物标志物 生物信息学 COL5A1 COL8A1 COL4A1
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 生命与体育科学
• 页码范围: 66-72
• 页数: 7页
• 分类号: R735.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.12046/j.issn.1000-5277.2020.06.009

摘要

为筛选胃癌临床诊断和预后的新型生物标志物,利用GEO2R工具分析胃癌基因芯片数据集GSE79973,筛选差异表达基因;采用FunRich、STRING和Cytoscape对差异表达基因进行GO、KEGG分析和蛋白互作网络构建;通过GEPIA比较候选基因在胃癌和正常组织中的表达水平;应用Kaplan-Meier Plot-ter和cBioPortal分析候选基因与临床胃癌的相关性及预后情况.通过数据分析,发现COL5A1、COL8A1和COL4A1的高表达对人类胃癌患者总生存期的危害最大,且在胃癌患者中这3个基因的突变可提高患者的总生存期.因此,COL5A1、COL8A1和COL4A1可作为人类胃癌临床预后潜在的生物标志物.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林陈胜		12	6	1.0	2.0
2	陈毅斌		3	0	0.0	0.0
3	李琳君		2	0	0.0	0.0