人前列腺癌组织DLL3基因生物信息学分析

• 作者: 张宁 盛爱民 马世堂
• 来源期刊: 安徽科技学院学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 生物信息学 DLL3基因 蛋白结构 前列腺癌 表达水平
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 生命科学
• 页码范围: 37-42
• 页数: 6页
• 分类号: Q-9
• 语种: 中文
• DOI: 10.19608/j.cnki.1673-8772.2017.0834

摘要

目的:研究人源前列腺癌组织DLL3基因生物信息学.方法:利用NCBI、ProtParam、DNAS-TAR、STRING、BioGPS、GEPIA、CCLE、TIMER等8个生物信息学平台,分别对人源DLL3基因序列、蛋白质理化性质、二级结构、疏水性以及DLL3基因在前列腺癌组织的表达情况进行分析.结果:人DLL3基因编码区长1857 bp,共618个氨基酸,分子式为C2791 H4376 N846 O825 S51,相对分子质量为64617.68,理化性质不稳定,二级结构以无规则卷曲为主,是一种亲水性蛋白质.通过BioGPS数据库分析DLL3 mRNA在正常的前列腺组织、T细胞和B细胞中DLL3表达水平较低;GEPIA显示在前列腺癌组织中DLL3的表达水平有所升高;CCLE显示在前列腺癌组织的T细胞中DLL3处于低表达,但在B细胞中表达略有升高.TIMER显示在前列腺癌免疫微环境中,DLL3的表达水平与免疫细胞B细胞、CD8+T细胞、巨噬细胞、CD4+T细胞、中性粒细胞和树突状细胞呈负相关,共表达量下降,但与肿瘤纯度呈正相关(偏相关系数partial.cor=0.187),表达量增加.结论:利用生物信息学方法对人DLL3基因及其蛋白进行研究,为前列腺癌等疾病的研究和相关药物研发提供相应参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张宁		20	21	3.0	4.0
2	盛爱民		1	0	0.0	0.0
3	马世堂		1	0	0.0	0.0