β-654地中海贫血小鼠骨髓红系终末分化的阶段特异性转录组特征

• 作者: 余东林 刘雪会 史丽芳 吕湘
• 来源期刊: 基础医学与临床
• 学科: 生物学
• 关键词: 转录组 β-654地中海贫血 热休克蛋白 蛋白质折叠
• 年，卷（期）: 2020,（9）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1182-1189
• 页数: 8页
• 分类号: Q811.4
• 字数: 5097字
• 语种: 中文

摘要

目的 探索β-654地中海贫血小鼠骨髓红系终末分化的阶段特异性转录组特点.方法 对β-654地中海贫血小鼠及同窝野生对照小鼠进行基因型鉴定及外周血涂片染色分析,而后对其骨髓细胞做流式细胞分选,收集原始红、早幼红、中幼红和晚幼红细胞用于转录组测序;测序数据过滤后进行基因差异表达分析,进一步对差异基因做GO富集分析并通过STRING数据库和Cytoscape软件对其中的上调基因进行蛋白质间相互作用网络和关键基因分析.结果 β-654地中海贫血小鼠骨髓红系细胞与同期正常对照间的差异基因随分化进程逐渐增多;GO分析显示地中海贫血早幼红-晚幼红细胞分化过程中分子伴侣介导的蛋白质折叠过程被逐渐激活,早幼红-中幼红时期氧化还原酶活性上调,中幼红-晚幼红时期泛素蛋白连接酶结合增强;蛋白质间相互作用分析发现分子伴侣中的热休克蛋白(Hsp)家族成员位于地中海贫血红系调控网络核心,且随贫血细胞向晚期分化该家族核心网络成员逐渐增多.结论 β-654地中海贫血小鼠骨髓红系细胞终末分化具有阶段特异性转录组变化,Hsp家族介导的蛋白质折叠过程随贫血细胞分化逐渐增强,早中幼红时期激活氧化还原反应,而中晚幼红时期以泛素化介导的蛋白降解为主.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	史丽芳	中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院医学分子生物学国家重点实验室	1	0	0.0	0.0
2	余东林	中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院医学分子生物学国家重点实验室	1	0	0.0	0.0
3	刘雪会	中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院医学分子生物学国家重点实验室	1	0	0.0	0.0
4	吕湘	中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院医学分子生物学国家重点实验室	8	22	2.0	4.0