细粒棘球绦虫多价EgA31-EgG1Y162抗原序列优化分析

• 作者: 丁剑冰 周晓涛 孔慧芳 张峰波 张杰 李玉娇 王红英
• 来源期刊: 中国免疫学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 细粒棘球绦虫 EgA31蛋白 EgG1Y162蛋白 表位
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 基础免疫学
• 页码范围: 19-25
• 页数: 7页
• 分类号: R392.9
• 字数: 5454字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-484X.2020.01.004

摘要

目的:将优化的EgA31-EgG1Y162抗原基因构建于pET30a上,诱导蛋白表达,SDS-PAGE鉴定蛋白表达效果,用生物信息学软件分析优化的EgA31-EgG1Y162抗原序列,为构建高效的疫苗奠定理论基础.方法:运用ProtParam,DNAstar,E.coli Codon Usage Analyzer等多种生物信息学软件分析优化后EgA31-EgG1Y162蛋白的理化性质,比较其优化前后序列的异同点及抗原表位分布情况等.结果:EgA31-EgG1Y162蛋白属于不稳定性蛋白且亲水性蛋白,通过网上在线软件分析,优化序列的密码子中不含利用率低的密码子.表位预测分析确定6个T细胞表位的氨基酸区域1～15、86～97、177～193、359～388、305～319、344～358和7个B细胞表位为102～112、172～204、318～334、343～353、394～409、415～431、443～458.结论:多价EgA31-EgG1y162融合抗原蛋白的优化序列中不含利用率低的密码子,且T和B细胞表位未受影响,为重组蛋白体外的有效表达奠定实验基础,对包虫病的多价表位疫苗研究具有重要的指导作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张杰	新疆医科大学基础医学院	99	381	10.0	14.0
2	王红英	新疆医科大学基础医学院	39	86	5.0	6.0
3	丁剑冰	新疆医科大学基础医学院	140	750	15.0	21.0
4	周晓涛	新疆医科大学基础医学院	27	34	3.0	5.0
5	张峰波	新疆医科大学基础医学院	45	129	7.0	9.0
6	李玉娇		24	50	4.0	6.0
7	孔慧芳	新疆医科大学基础医学院	1	0	0.0	0.0