凹线仙女蚬Cytb基因片段序列分析及系统进化树初步构建

• 作者: 徐其建 林岗 黄镇
• 来源期刊: 福建农业科技
• 学科: 农学
• 关键词: 凹线仙女蚬 Cytb基因片段 进化树 遗传距离
• 年，卷（期）: 2020,（10）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 1-9
• 页数: 9页
• 分类号: S917.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.13651/j.cnki.fjnykj.2020.10.001

摘要

初步探究凹线仙女蚬的系统发育地位,为凹线仙女蚬的分子遗传学研究提供前期数据.采用PCR方法扩增得到凹线仙女蚬Cyrenobatissa subsulcata线粒体细胞色素b(Cytb)基因片段序列,序列长为624 bp,并在NCBI上使用N T数据库进行Blast比对分析,进而构建系统进化树,探讨凹线仙女蚬的分类地位.结果显示NT数据库中未见凹线仙女蚬的Cytb基因信息.研究扩增获得的序列与蚬属其他种的Cytb基因片段有88％ 的相似性,与其他帘蛤目贝类的相似度77.02％ ～78.53％,表明扩增出的片段是凹线仙女蚬所特有的Cytb基因片段.基于Kimura′s 2-Parameter模型计算得出,3个样本个体的遗传距离仅为0～0.0016,远小于蚬属内种间遗传距离(0.002～0.114),与蚬属的遗传距离为0.127～0.144、与帘蛤目帘蛤科种类遗传距离为0.282～0.335.进化树显示,凹线仙女蚬样品独立聚为一支,与蚬属聚为一大支,支持度为99,表明仙女蚬属与蚬属的亲缘关系较近,与帘蛤科的遗传距离较远.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林岗		34	168	7.0	11.0
2	黄镇		7	29	3.0	5.0
3	徐其建		1	0	0.0	0.0