广灵驴ADD1基因的克隆和序列分析与组织表达

• 作者: 孙瑜彤 李树军 李武峰 赵婧微
• 来源期刊: 湖南农业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 广灵驴 ADD1基因 克隆 生物信息学分析 差异表达
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医·水产
• 页码范围: 733-741
• 页数: 9页
• 分类号: S822.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.13331/j.cnki.jhau.2020.05.015

摘要

运用RT-PCR方法,克隆广灵驴的ADD1基因的CDS区,对其进行序列分析,并通过qRT-PCR技术鉴定ADD1基因在广灵驴心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏和背最长肌中的相对表达水平.结果表明:广灵驴ADD1基因完整的CDS序列全长为2223 bp,可编码740个氨基酸,序列已提交到NCBI,登录号为MN_166472,其核苷酸序列与马的核苷酸序列的同源性最高,达99.6％;生物信息学预测ADD1蛋白为结构稳定的亲水性蛋白,理论等电点为5.58,二级结构主要以α-螺旋和无规则卷曲为主,存在1个Ⅱ类醛缩酶和内收蛋白N端超家族结构域,该蛋白没有信号肽及跨膜区域,主要定位在细胞核中,序列中共存在88个磷酸化位点,69个O-糖基化位点和3个N-糖基化位点;实时荧光定量检测结果表明,ADD1基因在广灵驴的6种组织中均有表达,但存在差异,在背最长肌中表达量最丰富,在肝脏中表达量最低.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李武峰		20	228	7.0	15.0
2	赵婧微		5	0	0.0	0.0
3	孙瑜彤		4	0	0.0	0.0
4	李树军		1	0	0.0	0.0