利用TCGA数据集分析PTPN5在肝癌中表达及其作用机制

• 作者: 张燕明 张跃 李婉君 李高 郑振东 韩涛
• 来源期刊: 临床军医杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 肝癌 PTPN5 TCGA数据集
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 260-263
• 页数: 4页
• 分类号: R735.7
• 字数: 1994字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16680/j.1671-3826.2020.03.06

摘要

目的 分析PTPN5在肝癌组织中表达及其可能的作用机制.方法 从TCGA数据集中收集肝癌及癌旁组织中的基因表达数据,提取癌及癌旁组织PTPN5分子表达水平,分析表达差异.联合患者临床信息分析PTPN5与临床指标相关性.利用GSEA分析PTPN5可能的作用机制.结果 癌组织PTPN5分子表达水平显著高于癌旁组织,差异有统计学意义(P<0.05).PTPN5表达水平与患者5年存活期及有无微血管侵犯相关(P<0.05).GSEA分析结果显示,PTPN5高表达的组织样本富集了细胞粘附因子、黏着斑激酶、MAPK、WNT信号传导通道等功能集团基因.结论 在肝癌组织中,PTPN5特异性表达,可能通过细胞粘附因子、黏着斑激酶、MAPK、WNT信号传导通道等功能集团发挥作用,其可能成为预测肝癌患者存活期的一项指标.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	韩涛	北部战区总医院肿瘤科	20	17	3.0	3.0
2	郑振东	北部战区总医院肿瘤科	17	15	3.0	3.0
3	李高		3	2	1.0	1.0
4	李婉君		1	0	0.0	0.0