贝母属植物叶绿体基因组候选SNP位点应用分析

• 作者: 兰璞 兰青阔 汪小福 王成 王永 赵新 陈笑芸 陈锐
• 来源期刊: 分子植物育种
• 关键词: 贝母属 叶绿体基因组 SNP位点 生物信息学分析 检测方法
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 标记辅助育种
• 页码范围: 231-237
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13271/j.mpb.018.000231

摘要

贝母属植物是中国中药材的宝库,由于形态上难以区分,在民间应用、临床应用和中药市场中还存在混淆应用、以次充好的现象,急需开发基于新型分子标记位点的精准检测方法.本研究应用多重序列比对、SNP筛选等生物信息学分析手段,对贝母属15种植物28条叶绿体基因组序列进行分析.结果 发现,贝母属叶绿体基因组DNA同源性达97.22％,通过分析共发现SNP位点5 879个,其中川贝母类鉴别候选位点71个,川贝母鉴别候选位点4个,瓦布贝母鉴别候选位点37个,太白贝母鉴别候选位点147个,浙贝母鉴别候选位点91个,湖北贝母鉴别候选位点271个,平贝母鉴别候选位点1 393个,伊贝母鉴别候选位点89个.本研究还对SNP位点在精准鉴定、精确定量应用方面进行了讨论,可为川贝母中药资源鉴定提供技术支撑.