转录组及代谢组联合解析玉米响应花粒期高温胁迫机制

• 作者: 乔江方 刘京宝 张盼盼 张美微 李川 牛军 黄璐
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 玉米 高温胁迫 花粒期 高通量转录组测序 代谢组学分析 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·生物技术
• 页码范围: 8-21
• 页数: 14页
• 分类号: S513
• 字数: 13727字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.20190649

摘要

为了探明我国玉米主要推广品种郑单958、先玉335花粒期高温胁迫下基因表达及代谢物差异,挖掘玉米响应高温胁迫的关键基因及代谢物,利用Illumina HiSeqTM 2500高通量测序技术分别对郑单958、先玉335高温胁迫7,14 d的穗位叶及对照叶进行高通量转录组测序,利用广泛靶向代谢组测序技术对样品进行高通量代谢物测序.转录组测序共获得214.81 Gb干净序列.郑单958高温胁迫7 d后检测到49个差异表达基因,其中24个为上调基因.继续高温胁迫14 d共检测到306个差异表达基因,其中130个为上调基因.高温胁迫7 d与高温胁迫14 d对比组中检测到1462个差异表达基因,其中647个为上调基因.先玉335高温胁迫7 d后共检测到381个差异表达基因,164个上调基因.继续高温胁迫14 d后共检测到299个差异表达基因,226个为上调基因.高温胁迫7 d与高温胁迫14 d对比组中共检测到2481个差异表达基因,其中1275个上调基因.在郑单958、先玉335高温胁迫7 d后对比组中检测到6646个差异表达基因,其中3253个上调基因.在郑单958、先玉335高温胁迫14 d对比组中检测到5958个差异表达基因,其中3110个上调基因.代谢物测序共检测到654个代谢物,郑单958高温胁迫7 d后共检测出28个差异代谢物,共注释到5个代谢通路中.高温胁迫14 d后共检测出54个差异代谢物,共注释到13个代谢通路中,其中9个差异代谢物呈上调表达.先玉335高温胁迫7 d后检测出98个差异代谢物,共注释到24个代谢通路中,其中43个差异代谢物呈上调表达.先玉335高温胁迫14 d后共检测出38个差异代谢物,共注释到13个代谢通路中,其中14个上调表达.郑单958高温胁迫7 d与先玉335高温胁迫7 d对比组共检测出144个差异代谢物,共注释到36个代谢通路中,其中81个差异代谢物呈上调表达.郑单958高温胁迫14 d与先玉335高温胁迫14 d对比组共检测出158个差异代谢物,共注释到40个代谢通路中,其中81个差异代谢物呈上调表达.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄璐	河南省农业科学院粮食作物研究所	34	316	9.0	17.0
2	李川	河南省农业科学院粮食作物研究所	19	136	6.0	11.0
3	乔江方	河南省农业科学院粮食作物研究所	21	143	6.0	11.0
4	张美微	河南省农业科学院粮食作物研究所	12	29	3.0	5.0
5	张盼盼	河南省农业科学院粮食作物研究所	6	0	0.0	0.0
6	牛军	河南省农业科学院粮食作物研究所	4	0	0.0	0.0