鼻咽癌STGC3基因转录调控元件分析与鉴定

• 作者: 刘慧晴 吴冬梅 唐磊 尹菊梅 李素云 袁靖哲 贺修胜
• 来源期刊: 解剖学杂志
• 关键词: STGC3基因 转录调控元件 核心启动子区
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 487-491,516
• 页数: 6页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-1633.2020.06.005

摘要

目的:分析并鉴定STGC3基因转录调控元件,探讨鼻咽癌STGC3基因的转录调控分子机制.方法:运用生物信息学,预测并分析STGC3基因核心启动子区的转录因子结合位点;将相关转录因子结合位点,制备3种探针即生物素标记野生型、突变型及未标记野生型;提取CNE2细胞核蛋白,利用电泳迁移率变动分析(EMSA)及染色质免疫共沉淀(ChIP)分析,体内外鉴定转录因子结合位点.结果:在STGC3基因核心启动子区存在21个转录因子结合位点,其中9个为Sp1转录因子结合位点;进一步严格限定参数,STGC3基因核心启动子区域含有转录因子结合位点5个,其中Sp1转录因子结合位点2个;EMSA和ChIP实验结果显示,STGC3基因中存在转录因子Sp1特异性结合位点,从而鉴定出STGC3基因转录调控元件.结论:STGC3基因核心启动子区含有Sp1特异性结合位点,为该基因的转录调控元件.