STGC3基因启动子生物信息学分析及载体构建

• 作者: 曾小微 李佳 李素云 熊文芳 王莉莉 贺修胜 钟嘉宏 陈青
• 来源期刊: 中南医学科学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 鼻咽癌 生物信息学 STGC3基因 启动子
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 基础医学
• 页码范围: 48-53
• 页数: 6页
• 分类号: R739.63
• 字数: 3400字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15972/j.cnki.43-1509/r.2017.01.011

摘要

目的 运用生物信息学预测并分析鼻咽癌抑癌基因STGC3启动子,构建双荧光素酶报告基因表达载体. 方法 采用生物信息学软件预测STGC3基因5'端上游调控区5 000 bp序列进行启动子预测与分析,克隆最有可能的启动子,构建萤火虫荧光素酶双报告基因重组质粒,重组质粒经MluⅠ和BglⅡ限制性内切酶酶切及测序鉴定.结果 STGC3基因5'端上游-3 046 bp至-46 bp区域内有启动子活性,在-2 992 bp至-69 bp间启动子分值达0.8以上,其中-845 bp至-795 bp间分值最高,达到1.0.在-1 140 bp和-774 bp处检测到GC盒信号;在-441 bp处检测到CAAT盒信号.在-1 805 bp至-1 705 bp和-900 bp至-684 bp间各有一个CpG岛;在-2 348 bp和-948 bp处各有一个转录起始位点.经不同长度的片段缺失比对,取最有可能的283 bp(-1 360 bp至-1 077 bp)、281 bp(-934 bp至-653 bp)和571 bp(-500 bp至+72 bp)启动子片段构建pGL3-en283、pGL3-en281及pGL3-en571三种质粒,质粒经酶切测序,酶切片段大小一致,序列正确. 结论 根据生物物信息学分析结果,成功构建STGC3基因启动子萤火虫荧光素酶报告基因表达载体,为双荧光素酶报告基因检测系统研究该基因启动子活性提供前期基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	贺修胜	南华大学肿瘤研究所	92	479	11.0	15.0
2	陈青	南华大学医学院	2	6	2.0	2.0
3	李素云	南华大学肿瘤研究所	34	168	7.0	11.0
7	李佳	南华大学医学院	22	75	5.0	8.0
8	王莉莉	湖北省大冶市人民医院病理科	1	4	1.0	1.0
9	钟嘉宏	南华大学医学院	1	4	1.0	1.0
10	熊文芳	南华大学医学院	1	4	1.0	1.0
11	曾小微	南华大学医学院	1	4	1.0	1.0