一株猪圆环病毒3型的全基因序列4测定及遗传进化分析

• 作者: 周远成 李盛辟 林艳 王雪涛 蔡雨涵 阴文奇 骆辉
• 来源期刊: 四川畜牧兽医
• 学科: 农学
• 关键词: PCV3 Cap蛋白 全基因 遗传进化
• 年，卷（期）: 2020,（7）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 23-26,29
• 页数: 5页
• 分类号: S852.659.2
• 字数: 2442字
• 语种: 中文

摘要

猪圆环病毒3型(PCV3)是一种与猪皮炎和肾病综合征、生殖功能衰竭和多系统炎症相关的新型猪圆环病毒.为了研究分析PCV3在四川本省的流行情况,本试验通过对实验室送检保存的50份病料进行PCV3阳性筛选、全基因扩增、送检测序,获得一株PCV3/CN/Sichuan/2019毒株,然后与挑选的18株参考毒株进行基因对比分析,得出该新毒株与国内河南毒株HeNYS-2 (2017)的遗传距离最近,Cap蛋白基因和全基因的同源性最高,分别达99.8％和100％;与国内8株参考毒株的全基因同源性为98.1％～98.8％,与国外9株参考毒株的全基因序列同源性为98.0％ ～ 98.6％;Cap蛋白基因序列同源性与国内外基本相同(99.1％～99.3％);进化树分析表明,该毒株与国内毒株进化距离最近,与国外毒株进化距离较远.本次发现的PCV3新毒株遗传进化稳定,没有出现明显变异,这将为四川省当前PCV3的分子流行病学研究提供一定的参考.