蜜蜂球囊菌菌丝和孢子的比较转录组分析

• 作者: 付中民 徐国钧 杜宇 熊翠玲 王杰 祝智威 范元婵 范小雪 蒋海宾 郭睿 陈大福
• 来源期刊: 四川大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 蜜蜂球囊菌 菌丝 孢子 信号通路 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 生物学
• 页码范围: 1177-1185
• 页数: 9页
• 分类号: S895.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0490-6756.2020.06.024

摘要

为探究实验室条件下纯培养的蜜蜂球囊菌(Ascosphaera apis)菌丝(AaM)和孢子(AaM)的共有基因、特有基因以及差异表达基因(differentially expressed gene,DEG)与真菌的生长、发育、生殖和致病性的相关性,利用RNA-seq技术和生物信息学方法对AaM和AaS进行比较转录组分析,并结合实时荧光定量PCR验证转录组数据的可靠性.分析结果显示AaM和AaS的共有基因为7 362个,涉及44个功能条目和122条通路;二者的特有基因分别为195和278个.AaM vs AaS比较组合有977个上调基因和687个下调基因,分别涉及32和32个功能条目;此外,上述DEG还涉及糖酵解/糖异生、次级代谢物的生物合成等113条通路.基于比较转录组分析发现球囊菌菌丝和孢子的共有基因、特有基因和DEG可能通过调节细胞活动、代谢进程、内吞作用以及MAPK信号通路等关键途径参与球囊菌的生长、发育和生殖过程.