东海1号大黄鱼SCD-1a和SCD-1b基因克隆及其对低温胁迫的应答

• 作者: 张立宁 李明云 李翀 苗亮 陈莹莹
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 东海1号大黄鱼 硬脂酰辅酶A去饱和酶1基因(SCD-1) 低温胁迫 组织应答
• 年，卷（期）: 2020,（10）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 1820-1829
• 页数: 10页
• 分类号: S965.3|Q785
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2020.10.010

摘要

大黄鱼(Larimichthys crocea)是暖温性鱼类,冬季低温可引起养殖大黄鱼大量死亡,有必要开展大黄鱼应对低温胁迫的研究.为明确大黄鱼硬脂酰辅酶A去饱和酶1基因(stearoyl coenzyme A desaturase 1,SCD-1)序列特征及其对低温胁迫应激的响应,本研究运用cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术从东海1号大黄鱼中克隆获得SCD-1a和SCD-1b的cDNA序列全长,并通过qRT-PCR分析二者在慢性和急性低温胁迫下的表达变化.SCD-1a cDNA(GenBank No.MT325796)全长3095 bp,开放阅读框1014 bp,编码337个氨基酸;SCD-1b cDNA(GenBank No.MT325797)全长2636 bp,开放阅读框1008 bp,编码335个氨基酸.序列比对显示,大黄鱼SCD-1a和SCD-1b基因编码的氨基酸序列相似性为72.2％,都含有3个保守的组氨酸富含区域;二者预测的蛋白质三级结构高度相似,均有4个跨膜螺旋.系统进化分析显示,鱼类SCD聚为2个大簇,大黄鱼SCD-1a和SCD-1b分别位于两簇中,表明二者为不同亚型.正常生长温度(18℃)下,SCD-1a和SCD-1b都在大黄鱼肝脏中高表达,在其他组织中弱表达.慢性低温胁迫(以0.5℃/12 h的速度降温、维持12 h后继续降温的方法由12℃缓慢降至6℃)条件下,鳃、皮肤、肌肉、肠和脑中SCD-1a表达量显著升高,肝中SCD-1a表达量显著降低,皮肤、肌肉、肠、脑和心脏中SCD-1b表达量显著升高;急性低温胁迫(将鱼由12℃池直接捞入8℃池)条件下,所有组织中SCD-1b均出现表达显著升高,SCD-1a在皮肤以外的组织均表达显著升高.本研究结果对于了解大黄鱼应对和适应低温胁迫的机制具有一定的参考意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张立宁		16	19	3.0	4.0
2	李明云		1	0	0.0	0.0
3	苗亮		1	0	0.0	0.0
4	陈莹莹		1	0	0.0	0.0
5	李翀		1	0	0.0	0.0