circRNAs对结直肠癌的抑制作用及其生物信息学分析

• 作者: 于逸 周凤娟 左海维 李霞 辛勇
• 来源期刊: 吉林大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 结直肠肿瘤 circRNA miRNA 基因表达数据 GEO数据库 靶基因
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 1283-1287,后插8,封3
• 页数: 7页
• 分类号: R735.35|R935.37
• 语种: 中文
• DOI: 10.13481/j.1671⁃587x.20200627

摘要

目的:探讨结直肠癌组织与癌旁组织的差异表达circRNAs,阐明hsa_circ_0043278对结直肠癌抑制作用的潜在机制.方法:从GEO数据库下载数据,GSE126094芯片数据包含10例结直肠癌组织样本与10例癌旁组织样本.采用R软件筛选出差异表达circRNAs;在CSCD数据库中找到与差异表达circRNAs结合的miRNAs;采用Perl软件预测miRNAs的靶基因;对靶基因进行GO生物学功能富集分析与KEGG信号通路富集分析.结果:与癌旁组织样本比较,结直肠癌组织样本中表达水平升高的circRNAs有23个(logFC>2且P<0.05),表达水平降低的circRNAs有36个(logFC<-2且P<0.05).hsa_circ_0043278表达水平降低最明显(logFC=-7.481且P<0.05).共有66个miRNAs与hsa_circ_0043278结合,并预测其靶基因.GO富集分析,靶基因主要参与Wnt介导的细胞信号转导.KEGG富集分析,靶基因主要富集在PI3K-AKT信号通路.结论:hsa_circ_0043278表达水平在结直肠癌组织样本中明显降低,间接影响靶基因UTP18、CLIP4与STC2等的功能,进而影响其对Wnt介导的细胞信号转导与PI3K-AKT信号通路的调控作用,最终减弱其对结直肠癌的抑制作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李霞	徐州医科大学附属医院	9	22	3.0	4.0
2	左海维	徐州医科大学附属医院	4	1	1.0	1.0
3	辛勇	徐州医科大学附属医院	10	6	2.0	2.0
4	周凤娟	徐州医科大学附属医院	4	0	0.0	0.0
5	于逸	徐州医科大学附属医院	1	0	0.0	0.0