迪庆藏猪FUT1基因遗传变异分析

• 作者: 刘韶娜 张斌 方晨 杨明华 胡瑞举 赵彦光 赵素梅 郭飞 黄英
• 来源期刊: 中国畜牧杂志
• 学科: 农学
• 关键词: 迪庆藏猪 FUT1 遗传变异 蛋白质结构
• 年，卷（期）: 2020,（12）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 29-35
• 页数: 7页
• 分类号: S828.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.19556/j.0258-7033.20200206-01

摘要

α( 1,2)岩藻糖转移酶基因1( α-1,2-Fucosyltransferase gene 1,FUT1 )是调节大肠杆菌F18黏附受体表达的一个候选抗性基因.实验旨在分析迪庆藏猪FUT1基因编码蛋白序列,为探索该基因编码蛋白的功能、建立地方猪种抗病育种候选基因和相关遗传标记以及分子育种提供一定的理论依据.本实验通过生物信息学方法对迪庆藏猪FUT1基因序列和氨基酸序列进行理化性质和分子结构预测分析,并比较分析猪、牛、人等物种遗传距离.结果显示:迪庆藏猪FUT1基因全长3 045 bp,存在4个错义突变;FUT1基因编码蛋白分子式为C4916H7548N1390O1353S46,是一种亲水性蛋白,无信号肽和跨膜结构,有92个潜在的磷酸化位点;组成FUT1蛋白的一级结构中,亮氨酸比例最高,酪氨酸最低;二级结构主要以α螺旋为主,具有结构分子活性;三级结构中其同源蛋白为c2hlhA,属于岩藻糖基转移酶家族成员.对比物种间FUT1基因序列,迪庆藏猪与滇南小耳猪亲缘关系近,与其他物种较远.