猪流行性腹泻病毒流行株S全基因的遗传进化与重组分析

• 作者: 党家刚 崔建涛 杨明凡 田润博 赵宇 郑兰兰 陈红英 韩昊莹
• 来源期刊: 中国兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪流行性腹泻病毒 S基因 遗传进化分析
• 年，卷（期）: 2020,（9）
• 所属期刊栏目: 预防兽医学
• 页码范围: 1671-1676
• 页数: 6页
• 分类号: S852.65
• 语种: 中文
• DOI: 10.16303/j.cnki.1005-4545.2020.09.02

摘要

为了解猪流行性腹泻病毒(PEDV)的遗传变异情况,本研究对2016-2018年间从河南和山西等地多个规模化猪场随机采集的25份患有腹泻仔猪小肠及内容物提取RNA进行PEDV RT-PCR检测,阳性样品进行S全基因克隆、遗传进化与重组分析.结果 显示,25份腹泻仔猪样品中检测出18个PEDV阳性样品,成功克隆18株PEDV毒株S全基因序列,与GenBank中发表的30条PEDV S基因序列进行比较分析,核苷酸同源性均在92.8％以上,存在多处碱基点突变、插入与缺失,且SX-TY1-2017毒株在3 291～4 132 nt位置处发生重组,可能是由亲本株CH/HNZZ47/2016和HN-KF-2017重组产生的.基于S全基因遗传进化树结果,克隆的18株PEDV属于G2群且位于不同分支,表明PEDV流行株在2016-2018年间出现一定的变异.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈红英		168	646	12.0	16.0
2	杨明凡		74	425	11.0	17.0
3	郑兰兰		17	27	4.0	5.0
4	韩昊莹		19	36	4.0	5.0
5	赵宇		21	81	5.0	8.0
6	田润博		7	12	2.0	3.0
7	崔建涛		11	211	4.0	11.0
8	党家刚		1	0	0.0	0.0