钩吻属植物及其易混品五指毛桃的DNA条形码比较分析

• 作者: 王虹 苏畅 张文娴 刘雪婷 吕浩锋 王铁杰 魏锋 马双成 王淑红
• 来源期刊: 中国现代中药
• 学科: 医学
• 关键词: 钩吻 北美钩吻 五指毛桃 DNA条形码 内转录间隔区 psbA-trnH
• 年，卷（期）: 2020,（12）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 1967-1971
• 页数: 5页
• 分类号: R281.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.13313/j.issn.1673-4890.20200315002

摘要

目的:对钩吻属植物钩吻和北美钩吻进行2种DNA条形码的碱基序列分析,结合药食同源品种五指毛桃构建系统进化树,为五指毛桃药材的真伪鉴定提供参考.方法:对钩吻、北美钩吻和五指毛桃样品进行内部转录间隔区2(ITS2)序列和psbA-trnH序列的扩增测序,比对分析2种DNA条形码扩增产物碱基组成、GC含量、差异位点的差异;通过构建Kimura 2-parameter(K2P)双参数模型计算和分析种内、种间遗传距离;基于邻接法构建系统进化树,分析ITS2序列和psbA-trnH序列的鉴定效率.结果:ITS2区和psbA-trnH区序列均可作为钩吻属植物与五指毛桃鉴定的DNA条形码序列.其中psbA-trnH区在钩吻属种间的碱基序列长度、种间变异位点数量均具有显著差异,系统进化树的聚类结果稳定性更强,比ITS2更适用于该属植物样本的鉴别.结论:psbA-trnH序列可作为钩吻和北美钩吻鉴定首选DNA条形码,ITS2序列可作为五指毛桃与钩吻属植物鉴定的首选DNA条形码.