利用鸡胚表达谱数据筛选皮肤发育相关基因的研究

• 作者: 樊庆灿
• 来源期刊: 中国畜牧杂志
• 学科: 农学
• 关键词: 表达谱 羽毛上皮 鳞片上皮 FAK GEO
• 年，卷（期）: 2020,（9）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 78-83
• 页数: 6页
• 分类号: S831.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.19556/j.0258-7033.20191217-08

摘要

家鸡(Gallus domesticus)躯体被覆羽毛而跖部为鳞片状皮肤,代表了比较典型的皮肤结构,是研究皮肤调控机理的理想模型.本研究利用来航鸡胚胎期背部和跖部皮肤的表达谱数据(GSE62882),筛选不同日龄胚胎背部羽毛皮肤上皮(7 d、9 d)、间充质(7 d、9 d)和跖部鳞片皮肤上皮(9 d、11 d)、间充质(9 d、11 d)的差异表达基因,探讨胚胎皮肤发育的调控通路.结果 显示:羽毛皮肤上皮(7 d、9 d)鳞片皮肤上皮(9 d、11 d)差异表达显著基因(Padj<0.05),分别为28个和116个;对4组极表达差异显著基因(P<0.01)进行GO分析,发现富集在单细胞组织发育相关条目的 差异基因最多,羽毛上皮(7 d、9 d)部分差异基因富集在细胞黏附;4组差异基因的KEGG分析中,筛选出共同的信号通路黏附斑激酶(FAK)信号通路,该通路介导的细胞黏附活动可能参与鸡胚胎皮肤发育过程.血小板源性生长因子(Platelet Derived Growth Factor Subunit B,PDFGB)、关键基因纤维连接蛋白1(Fibronectin1,FN1)和细胞基质蛋白(Periostin,POSTN)参与FA K信号通路,是值得关注的基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	樊庆灿		3	0	0.0	0.0