基于网络药理学和分子对接技术探讨生脉注射液抗新型冠状病毒肺炎的作用机制

• 作者: 张小飞 徐杰 李慧婷 杨明 柳小莉 王堯 王梁凤 王芳 陈青垚
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 生脉注射液 新型冠状病毒肺炎 网络药理学 分子对接 KEGG通路富集分析 成分-靶点-通路 CASP3 PTGS2 NOS2 NOS3 ICAM1 五味子内酯E 豆甾醇 N-反式阿魏酰酪胺 抗炎 免疫调节 抗休克 增加血氧饱和度
• 年，卷（期）: 2020,（11）
• 所属期刊栏目: 药理与临床
• 页码范围: 2977-2987
• 页数: 11页
• 分类号: R285.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2020.11.016

摘要

目的 采用网络药理学与分子对接技术探讨生脉注射液的活性成分和治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在作用机制.方法 利用TCMSP及BATMAN-TCM数据库筛选生脉注射液的活性化合物,通过TCMSP及Targetnet在线数据库预测作用靶点,通过Cytoscape 3.7.1构建活性成分-作用靶点网络图;在GeneCards及OMIM数据库中以“coronavirus pneumonia”为关键词搜索冠状病毒肺炎相关疾病靶点,与生脉注射液化合物靶点进行交集筛选出共同靶点作为研究靶点,将共同靶点导入STRING数据库获取数据后在Cytoscape 3.7.1软件中构建蛋白质-蛋白质相互作用网络图;利用R语言进行GO (gene ontology)功能、KEGG (Kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路富集分析,预测其作用机制,并构建“成分-靶点-通路”网络图;通过DiscoveryStudi0 2.5软件对关键靶点进行分子对接分析.结果 生脉注射液筛选得到22个活性化合物,分别为邻苯二甲酸二辛酯、β-谷甾醇、当归酰基戈米辛O、戈米辛A、戈米辛R、五味子丙素、内南五味子酯乙、长南酸、南五味子内酯、香蒲木脂素B、新杜松烷酸A、新杜松烷酸B、新杜松烷酸C、新南五味子木脂宁、五味子内酯A、五味子内酯E、五味子酸、尿苷、薯蓣皂苷元、鸟嘌呤核苷、N-反式阿魏酰酪胺、豆甾醇.相应作用靶点224个,与COVID-19的共同靶点16个,分别为CASP3、CASP8、PTGS2、BCL2、BAX、PRKCA、PTGS1、PIK3CG、F10、NOS3、DPP4、NOS2、TLR9、ACE、ICAM1、PRKCE,关键靶点涉及CASP3、PTGS2、NOS2、NOS3、ICAM1.GO功能富集分析得到生物过程(BP)条目771个,细胞组成(CC)条目11个,分子功能(MF)条目79个.KEGG通路富集分析筛选得到67条(P＜0.05)信号通路,主要涉及糖尿病并发症AGE-RAGE信号通路、凋亡通路、P53信号通路、小细胞肺癌通路等.分子对接结果显示与关键靶点对接较好的成分有五味子内酯E、豆甾醇、N-反式阿魏酰酪胺.结论 生脉注射液中的活性化合物五味子内酯E、豆甾醇、N-反式阿魏酰酪胺等能作用于CASP3、PTGS2、NOS2、NOS3等靶点调节多条信号通路发挥抗炎、免疫调节、抗休克、增加血氧饱和度等作用,从而可能发挥对COVID-19的治疗作用.