基于网络药理学和分子对接技术探讨蔓荆子防治 急性心肌梗死的作用机制

• 作者: 陈礼琴 徐彤彤 吕祥威 武琦 覃秋语 赵位昆
• 来源期刊: 中西医结合心脑血管病杂志
• 关键词: 急性心肌梗死 蔓荆子 网络药理学 分子对接
• 年，卷（期）: 2024,（21）
• 所属期刊栏目: 临床医学论著
• 页码范围: 7-18
• 页数: 12页
• 语种: 中文

摘要

目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨蔓荆子防治急性心肌梗死(AMI)的作用机制。方法:应用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)对蔓荆子的有效成分及作用靶点进行筛选，通过SwissTargetPrediction平台进行补充；利用UniPort数据库注释靶点基因；通过GeneCards、DisGeNET、TTD、OMIM数据库获取AMI的疾病靶点；将药物靶点与疾病靶点取交集，采用Cytoscape 3.9.1软件构建“药物-药物化合物-靶点”可视化网络图；应用Rstudio 4.1.3通过Bioconductor数据库对交集靶点进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析；通过STRING数据库对交集靶点进行蛋白相互作用(PPI)分析，利用Cytoscape 3.9.1软件CytoHubba插件对PPI网络进行分析，获得关键靶点。通过AutoDock Tools 1.5.7软件和Pymol 2.4.0对部分关键靶点蛋白受体和化合物配体进行分子对接验证和可视化分析。结果:筛选得到蔓荆子中的活性成分共计27个，药物与疾病交集靶点185个；通过蔓荆子-药物化合物-靶点网络模型发现其防治AMI的主要活性成分为槲皮素、木犀草素、山柰酚、豆甾醇、牡荆素C;GO分析显示主要与调节脂多糖应答的生物过程相关，KEGG通路富集分析显示主要作用机制可能与脂质和动脉粥样硬化、糖尿病并发症受体信号通路、血流剪切应力与动脉粥样硬化、白细胞介素-17(IL-17)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号转导通路有关。结论:蔓荆子对AMI的干预作用具有多成分、多靶点、多通路、多环节的调控特点，可能通过调节脂代谢、抗炎、免疫调节、促进血管生成以及调节细胞自噬等过程发挥治疗作用。