基于条件互信息的乳腺癌易感基因网络的构建和分析

• 作者: 王新赠 王淑栋 范晓丹
• 来源期刊: 计算机与数字工程
• 学科: 工学
• 关键词: 条件互信息 SNP-SNP相互作用网络 网络中心性 致病SNPs
• 年，卷（期）: 2020,（11）
• 所属期刊栏目: 信息处理与网络安全
• 页码范围: 2649-2653
• 页数: 5页
• 分类号: TP391
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-9722.2020.11.022

摘要

从与复杂疾病相关的基因上的单核苷酸多态性(SNPs)数据出发构建网络,可有效挖掘SNPs间相关性,进而实现疾病相关SNPs的定位.传统的相关性系数仅能度量SNPs间的线性关系,互信息可发掘非线性关系,但存在有偏估计,导致推断出的SNP网络错误率较高.因此,论文基于条件互信息(CMI)及最佳的CMI阈值,对彼此间CMI值大于阈值的SNPs进行连边,建立病例组和对照组SNP-SNP相互作用网络,并分析网络中节点拓扑特征属性,最终筛选出可能的致病SNPs.实验结果表明:论文方法能够快速准确地得到致病SNPs集合.