基于DNA条形码技术的北柴胡种子分子鉴定

• 作者: 刘金欣 央拉 石林春 谢红波 赵春颖 赵晴 魏妙洁
• 来源期刊: 中国实验方剂学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 北柴胡 种子 DNA条形码 核糖体DNA内转录间隔区(ITS)序列 分子鉴定 混伪品 三岛柴胡
• 年，卷（期）: 2020,（14）
• 所属期刊栏目: 药学基础
• 页码范围: 182-189
• 页数: 8页
• 分类号: R22|R931|R282|C37|Q523
• 语种: 中文
• DOI: 10.13422/j.cnki.syfjx.20200650

摘要

目的:建立基于核糖体DNA内转录间隔区(ITS)序列的北柴胡种子分子鉴定方法,保障北柴胡栽培种子的物种准确.方法:收集北柴胡及主要栽培柴胡属物种种子、市售北柴胡种子样品共59份,探究不同取样量和不同水浴条件对种子DNA提取质量的影响,建立柴胡属种子DNA提取方法;通过聚合酶链式反应(PCR)和双向测序得ITS条形码序列.从GenBank下载34条北柴胡、红柴胡、黑柴胡等主要栽培柴胡属物种ITS序列,丰富北柴胡种子鉴定数据库;利用MEGA-X10.0.5进行变异位点分析并构建邻接(NJ)系统发育树,考察ITS序列对北柴胡种子的物种鉴定能力;基于BLAST方法和NJ系统发育树法对市售北柴胡种子进行DNA条形码鉴定.结果:共获得59条北柴胡、红柴胡、三岛柴胡及市售北柴胡种子的ITS序列,北柴胡ITS序列可分为6个单倍型,包含7个变异位点,NJ系统发育树表明北柴胡所有单倍型可形成独立的枝,与所收集样品中其他柴胡属栽培物种可相互区分,具备北柴胡种子物种鉴定能力.基于ITS条形码序列鉴定发现19份市售北柴胡种子中有3份为三岛柴胡,伪品率15.8％.结论:基于ITS序列的DNA条形码技术可以准确可靠地鉴定北柴胡种子及其易混品,可为我国中药材种子规范化建设提供参考.