基于ITS2条形码及其二级结构的菊科药用植物的系统发育分析

• 作者: 韩芳平 谢才友 兰卓 任瑶瑶 谭睿
• 来源期刊: 世界科学技术-中医药现代化
• 关键词: 菊科 DNA条形码 ITS2序列 二级结构 分子鉴定
• 年，卷（期）: 2020,（10）
• 所属期刊栏目: 中药研究|Chinese Materia Medica
• 页码范围: 3760-3767
• 页数: 8页
• 分类号: R288
• 语种: 中文
• DOI: 10.11842/wst.20190505007

摘要

目的 采用ITS2(Internal transcribed spacer2,内转录间隔区2)序列作为条形码技术对菊科药用植物进行鉴别.方法 选取来自西藏自治区及四川康定、乐山和峨眉地区的菊科样品44种,提取DNA并对其进行PCR(Polymerase Chain Reaction,聚合酶链式反应)扩增,后测序,测序结果提交至GenBank;同时从GenBank上下载17条样本序列.使用MEGA7.0软件计算所提交和下载的61条序列的种内与种间遗传距离,采用邻接法(neighbor-joinging,NJ)构建系统聚类树直观反应鉴定结果.从ITS2数据库中预测并比较样本ITS2序列的二级结构差异.结果 菊科植物种间最小遗传距离0.031大于种内最大遗传距离0.009,有较明显的barcoding gap;NJ树显示种各属样本分别聚为一大枝,种内之间各自聚成小支,表现出良好的单系性;各属及各种样品ITS2二级结构存在明显差异.结论 以ITS2序列作为DNA条形码,能够对菊科药用植物进行准确、迅速的识别与鉴定,是物种间进化关系准确的分子鉴定依据,可为该科植物的分布、种群及种群数量的研究提供指导,为控制药品质量、合理开发利用及保护提供了新手段.