针对分类模型在处理基因表达小样本高维度数据集上存在的分类准确性不足、过拟合、计算复杂度大等问题,提出一种改进模型Two Boosting Deep Forest(TBDForest).在多描部分采用均等式特征利用方法对原始特征进行变换;在分类过程中考虑到模型所集成的每个森林的拟合质量,将上层最重要的部分判别特征输入到下一级联层,在层间改善类分布问题;对原级联层采用子层级联的结构,增加样本训练机会,减少训练开销,避免模型对参数的依赖.通过在五种疾病基因表达小样本数据集上的验证结果表明,改进的模型增强分类算法在小样本数据集的分类性能上达到了更好的分类效果.