副溶血弧菌的MALDI-TOF MS与16S rRNA鉴定法

• 作者: 董雪 刘宏生 蔡克亚 赵翊祺 冯华炜 李继耀 刘蕴博 赵高岭 刘美丽 刘娜 刘建敏 李欣 蔡艳婷
• 来源期刊: 职业与健康
• 学科: 医学
• 关键词: 副溶血弧菌 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 16S核糖核苷酸测序 鉴定
• 年，卷（期）: 2020,（23）
• 所属期刊栏目: 实验·监测与检验
• 页码范围: 3202-3208
• 页数: 7页
• 分类号: R117
• 语种: 中文

摘要

目的 分析用基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)与16S rRNA鉴定副溶血弧菌(VP)的准确性、快速性以及经济性.方法 用Autof ms1000质谱仪鉴定37株从沈阳市疾病预防控制中心获得的弧菌,获得鉴定结果和弧菌图谱,同时做聚类分析与16S rRNA测序.结果 37株弧菌质谱鉴定后得出编号1～9、11～37为副溶血弧菌,10为霍乱弧菌,鉴定结果种属水平可信.16S rRNA鉴定出1～9、10、11～37均为弧菌属,第一匹配和第二匹配相似率差异＜0.8％.结论 Autof ms1000在鉴定菌株方面经济快速,鉴定37株弧菌准确性在属水平上达到100％,种水平上达到97.3％,在属水平上与16S rRNA测序高度一致.