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含油量是油菜最重要的性状之一, 目前已有较多的油菜种子含油量定位研究, 然而各研究系统相对独立, 群体与标记的差别使得难以比较不同研究结果。本研究连续4年种植了一个含308份材料的油菜自然群体, 结合60K SNP芯片数据对种子含油量进行了全基因组关联分析(GWAS), 并将所鉴定的显著位点与早前2个自然群体及10个分离群体鉴定到的位点进行全基因组比较与整合。结果显示, 通过GWAS共检测到8个与种子含油量显著关联的位点, 单个位点解释的表型变异度为3.22%~5.13%; 结合其他12个群体的定位结果, 共获得193个油菜含油量整合位点, 分布于油菜的所有19条染色体, A亚基因组平均每条染色体有13个位点, 显著高于C亚基因组(7个)。对不同群体鉴定结果的比较发现, 7个整合区间能在至少3个群体中被检测到, 均位于A亚基因组染色体(A01、A02、A03、A06、A08、A09和A10)上, 其中有3个与C亚基因组上的区间存在同源性, 在这3个区间中共鉴定到26个已知的油脂代谢相关基因。本研究将193个位点锚定到法国公布的甘蓝型油菜参考基因组, 构建了一个可视的油菜种子含油量位点全基因组整合系统, 可为油菜种子含油量重要位点的确定提供帮助, 并为制定提高油菜种子含油量的育种方案提供参考。
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文献信息
篇名 油菜种子含油量GWAS分析及位点整合系统构建
来源期刊 作物学报 学科
关键词 甘蓝型油菜 种子含油量 全基因组关联分析 QTL 整合系统
年,卷(期) 2021,(9) 所属期刊栏目 研究论文
研究方向 页码范围 1311-1319
页数 8页 分类号
字数 语种 中文
DOI 10.3724/SP.J.1006.2018.01311
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研究主题发展历程
节点文献
甘蓝型油菜
种子含油量
全基因组关联分析
QTL
整合系统
研究起点
研究来源
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引文网络交叉学科
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期刊影响力
作物学报
月刊
0496-3490
11-1809/S
大16开
1950-01-01
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