基于SSR标记的白栎天然居群遗传多样性分析

• 作者: 臧明月 李璇 方炎明
• 来源期刊: 南京林业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 白栎 SSR 遗传多样性 遗传结构
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 63-69
• 页数: 7页
• 分类号: S722|S792.184
• 语种: 中文
• DOI: 10.12302/j.issn.1000-2006.202004049

摘要

[目的]利用SSR分子标记,对白栎天然居群进行遗传多样性分析,为其种质资源的合理开发与保护提供指导.[方法]采用筛选出的SSR引物对3个群体进行遗传多样性与遗传结构研究,并计算遗传参数;基于个体间的遗传距离进行主成分分析,运用GenAlEx 6.5进行遗传距离与地理距离的相关性Mantel检验,软件Arlequin用于分子方差分析,聚类分析采用MEGA 7中的UPGMA法;同时,使用Structure软件中的贝叶斯聚类算法探究群体遗传结构.[结果]6对SSR引物共检测到75个等位基因,平均有效等位基因数、观察杂合度和期望杂合度分别为7.16、0.70和0.80,Shannon信息指数为2.05.AMOVA表明,群体内部的分子变异率高达97.41％,而群体之间的遗传变异仅为2.59％.黄山(YM)与天目山(TM)群体间的基因流为12.908,显著高于其他群体之间的交流水平,而二者间有着最近的遗传距离为0.272.贝叶斯法与UPGMA法聚类结果一致,表明来自YM与TM的个体亲缘关系更近.[结论]白栎具有较高的遗传多样性水平,且不同居群间的水平相当.YM和TM居群的基因交流最为密切,遗传分化不明显.白栎绝大部分遗传变异来源于群体内部,对于该物种的保护应减少不合理的人为开发行为,以原地保护为主,同时开展种质资源的收集与遗传改良工作.