基于单细胞ATAC测序技术对18-三体综合征染色质开放性区域转录因子的分析

• 作者: 何慧燕 周俊 廖秋燕 戴勇 杨明 梁灼健 汤冬娥 胡芷洋 虞海燕 许承明 赵鑫 邱晓芬
• 来源期刊: 遗传
• 关键词: 18-三体综合征 单个核细胞 单细胞ATAC测序 转录调控 转录因子
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 74-88
• 页数: 15页
• 语种: 中文
• DOI: 10.16288/j.yczz.20-283

摘要

18-三体综合征是常见的常染色体非整倍体疾病之一,长期以来人们对18-三体综合征疾病的临床表型(如智力障碍、心脏、肾脏异常等)发生及发展相关的基因调控知之甚少.为探索影响该疾病表型的调控因子,本研究利用单细胞ATA C测序技术,对18-三体综合征和对照组的脐带血单个核细胞的开放性染色质区域的转录因子进行分析.捕获11,611个细胞构建的单细胞文库鉴定得到7种主要免疫细胞群,细胞数量统计的结果提示18-三体综合征的免疫系统异常.通过分析开放性染色质区域,筛选得到14个转录因子(P<0.05,|FC|>1.2).采用实时荧光定量PCR验证其中4个转录因子(TEAD1、TEAD2、TEAD4、Twist2)的相对表达量的结果符合预期.上述研究结果表明这4个转录因子可能与18-三体综合征患者心脏和骨骼发育的异常相关,为18-三体综合征表型的发生及发展的机制研究提供候选分子.