宏基因二代测序在假体周围感染病原菌检测中的应用

• 作者: 郝林杰 张育民 文鹏飞 宋伟 王军 马涛
• 来源期刊: 中华关节外科杂志（电子版）
• 关键词: 关节成形术,置换 假体相关感染 宏基因组 高通量核苷酸测序
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 临床论著|CLINICAL RESEARCHES
• 页码范围: 185-191
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3877/cma.j.issn.1674-134X.2021.02.009

摘要

目的 探讨宏基因二代测序技术在关节置换术后假体周围感染病原菌检测中的应用价值.方法 回顾性分析2018年1月至2019年10月西安市红会医院收治的诊断为关节置换术后假体周围感染患者临床资料,排除2周内应用抗生素患者及由于送检标本质量不合格导致mNGS检测失败者,最终纳入研究者34例,所有患者均取术中样本送细菌培养及宏基因二代测序检测,分别记录细菌培养及宏基因二代测序结果,记录阳性例数,比较阳性率及检测所需时间,记录两种检测方法的菌种类别,采用配对卡方检验或配对t检验进行统计学分析.结果 总计34例假体周围感染患者中,男14例,女20例,平均年龄(67.9±11.7)岁;膝关节感染23例,髋关节感染11例.细菌培养阳性者20例,阳性率58.8％,宏基因二代测序检测阳性者30例,阳性率88.2％,差异有统计学意义(x2=7.556,P<0.05).从微生物标本送检至报告结果,细菌培养所需时间平均为(5.2±2.1)d,宏基因二代测序检测所需时间平均为(1.6±0.6)d,差异有统计学意义(t=9.678,P<0.05).两种方法所测病原微生物均以革兰阳性菌为主,最常见的3种病原体是金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌和大肠埃希菌.结论 采用宏基因二代测序检测方法细菌检出率明显高于细菌培养,所需时间明显短于细菌培养,在人工关节置换术后假体周围感染患者病原菌检测中更有优势.