miRNA-143-3P在组织中的表达及其靶基因预测与功能分析

• 作者: 吴巧群 崔小芝 杨丽红 许厚强
• 来源期刊: 生物技术
• 关键词: 香猪 组织表达 靶基因预测 生物功能
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 技术与方法|Technique and Method
• 页码范围: 153-159
• 页数: 7页
• 分类号: Q784
• 语种: 中文
• DOI: 10.16519/j.cnki.1004-311x.2021.02.0023

摘要

[目的]探究miRNA-143-3P在从江香猪与杂交猪之间是否存在表达水平的差异性,预测分析该miRNA的靶基因及其功能,分析miR-143-3P在这两个猪种中的功能.[方法]通过RT-qPCR检测从江香猪与杂交猪中不同组织的miRNA-143-3P,利用线软件预测miRNA-143-3P的靶基因,对筛选的靶基因作生物信息学分析,了解miRNA-143靶基因的功能.[结果]荧光定量PCR检测的结果显示,在从江香猪中的表达量最高的是肝脏,而杂交猪的是脾脏,存在表达差异极显著的组织有肺、大肠、小肠、脾、肝(P＜0.01).软件预测靶基因时,共存的有30个.生物功能分析时发现,这些基因多数存在于细胞质(53.6％)和细胞核(46.4％)中,而在蛋白质结构域是在跨膜区和螺旋区占多数,分别占26.9％、23.1％,而在与转录因子结合较多的是SP1(71.4％),组织表达较高的为肺、肝、肾,高达80％,而热图显示RA4B7A、LASP1、MYO6、KRAS这四个基因在数据库中的富集相对较广.[结论]miRNA-143-3P在从江香猪与杂交猪之间存在表达性差异,这种差异与该miRNA-143-3P所对应的靶基因功能相关.