怀玉山高山马铃薯抗TMV蛋白基因的克隆和序列分析

• 作者: 洪森荣 曾晓健 魏杰 温倩文 谢微 杨玉琪 姚梦 易奥情 于小姣 蔡红 陈荣华
• 来源期刊: 西南农业学报
• 关键词: 怀玉山高山马铃薯 试管苗 抗TMV蛋白基因 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2021,（3）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源|CROP GENETICS & BREEDING·GERMPLASM RESOURCES
• 页码范围: 487-494
• 页数: 8页
• 分类号: S532
• 语种: 中文
• DOI: 10.16213/j.cnki.scjas.2021.3.004

摘要

[目的]对怀玉山高山马铃薯抗TMV蛋白基因进行克隆和序列分析,为揭示怀玉山马铃薯抗TMV蛋白的生物学功能提供理论依据.[方法]通过怀玉山高山马铃薯试管苗转录组数据库筛选到抗TMV蛋白基因的核心片段,利用RT-PCR技术克隆怀玉山高山马铃薯抗TMV蛋白基因,并采用生物信息学方法进行序列分析.[结果]怀玉山高山马铃薯抗TMV蛋白基因cDNA总长度为4335 bp,G+C含量为38.22％;怀玉山高山马铃薯抗TMV蛋白由1444个氨基酸组成,分子量165 229.13 Da,等电点5.78,为亲水性蛋白;二级结构由α-螺旋(43.77％)、β-片层(12.47％)、无规则卷曲(43.77％)构成;高山马铃薯抗TMV蛋白主要存在细胞核中;怀玉山高山马铃薯抗TMV蛋白在进化上与马铃薯、番茄和野生种潘那利番茄的亲缘关系较近,尤其是与Solanum tu-berosum(马铃薯)TMV resistance protein N-like isoform X1(类TMV抗性蛋白N亚型X1)和S.tuberosum(马铃薯)TMV resistance protein N-like isoform X2(类TMV抗性蛋白N亚型X2)在进化上具有最高的亲缘关系.[结论]怀玉山高山马铃薯抗TMV蛋白具有典型抗TMV蛋白的结构特征,氨基酸序列及核酸序列与同源物种相似度高,在进化上高度保守,对进一步揭示该蛋白生物学功能具有重要意义.