基于16S rRNA和gyrB基因串联DNA特征序列的副溶血性弧菌鉴定

• 作者: 冯震 张芝华 肖珊珊 张欢 秦峰 杨美成
• 来源期刊: 上海预防医学
• 关键词: 副溶血性弧菌 16S rRNA基因 gyrB基因 串联序列 系统发育分析
• 年，卷（期）: 2021,（5）
• 所属期刊栏目: 专稿:食品安全
• 页码范围: 372-376
• 页数: 5页
• 分类号: R917
• 语种: 中文
• DOI: 10.19428/j.cnki.sjpm.2021.20874

摘要

[目的]建立基于16S核糖体RNA(16S rRNA)和DNA促旋酶亚基B(gyrB)基因串联DNA特征序列的副溶血性弧菌鉴定方法,为菌株鉴定和分类提供研究思路和方法依据.[方法]选择副溶血性弧菌、溶藻弧菌以及弧菌属的其他代表性菌株,分别以16S rRNA和gyrB基因为研究靶点,设计引物进行特异性核酸序列扩增和核酸测序,将串联后的核酸序列进行聚类比对分析,判断鉴定结果.[结果]副溶血性弧菌鉴定的16S rRNA+gyrB基因串联DNA特征序列单独聚类为1个分支,在种的鉴定水平具有较好的分辨力.[结论]基于16S rRNA +gyrB串联DNA特征序列,可将副溶血性弧菌鉴定到种的水平,是该菌株污染物的系统发育分析及在食品药品安全监管中的风险溯源的方法与依据.