医蛭形亚目常见物种系统发育基因组学研究

• 作者: 赵芳 蒋凯 苏田娟 何波 吴清 林恭华 黄族豪
• 来源期刊: 井冈山大学学报（自然科学版）
• 关键词: 医蛭形亚目 基因组 转录组 系统发育
• 年，卷（期）: 2021,（4）
• 所属期刊栏目: 生命科学|LIFE SCIENCE
• 页码范围: 41-47
• 页数: 7页
• 分类号: X705
• 语种: 中文
• DOI: 10.3669/j.issn.1674-8085.2021.04.009

摘要

本研究基于GenBank中10个医蛭形亚目物种及2个近缘外类群的基因组或转录组数据,提取COI、18 S和蛋白编码核基因的直系同源序列(Orthologs),开展系统发育分析.比对后的COI、18 S和Orthologs序列长度分别为1533、1832、220095 bp.最大似然法和贝叶斯推断法分析显示,基于Orthologs序列构建的系统发育树在几乎所有节点上的支持率都达到100％,明显优于COI和18 S序列得到的结果.研究表明,医蛭科的欧洲医蛭、东方医蛭和侧纹医蛭组成一个单系群,医蛭科的日本医蛭与黄蛭科的宽体金线蛭和尖细金线蛭组成另一单系群,而黄蛭科的马蛭与上述6个物种形成姐妹群.医蛭科的两种牛蛭(菲牛蛭和棒纹牛蛭)组成一个单系群,此单系群与医蛭科的其他物种的遗传关系比马蛭更疏远;山蛭科的洞穴山蛭在10个医蛭形亚目种类中处于最基部位置.本研究阐明了医蛭形亚目常见物种的系统发育关系,为这些物种的资源开发利用和保护提供科学依据.