基于生物信息学筛选三阴性乳腺癌生物标志物及小分子药物的研究

• 作者: 杨柳 陈玲玉 张蕾
• 来源期刊: 农垦医学
• 学科: 医学
• 关键词: 三阴性乳腺癌 生物信息学 生物标志物 小分子治疗药物
• 年，卷（期）: 2021,（5）
• 所属期刊栏目: 基础与临床研究
• 页码范围: 385-390
• 页数: 6页
• 分类号: R737.9
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1008-1127.2021.05.001

摘要

目的:确定三阴性乳腺癌(Triple negative breast cancer,TNBC)潜在生物标志物和小分子治疗药物.方法:GSE65212和 GSE53752的相关数据来自基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO);clusterProfile 软件包用于DEGs基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析;Kaplan-Meier Plotter 网站和癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库评估中枢基因的临床价值;基于CMap数据库探索TNBC潜在小分子治疗药物.结果:本研究在GSE65212和GSE53752芯片数据集中共鉴定出888个差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs);GO分析表明,DEGs与有丝分裂核分裂以及有丝分裂姐妹染色单体分离密切相关;KEGG分析显示,DEGs直接或间接参与了细胞周期,细胞衰老和细胞凋亡等过程;生存分析表明 CDCA8,BUB1,AURKB,BUB1B,KIF2C,NCAPG,CCNA2,CCNB2和 DLGAP5与患者不良预后相关(P＜0.05);CMap数据库鉴定出3种小分子药物quinostatin,MS-275和apigenin(P＜0.05).结论:本研究获得的9个中枢基因和3种小分子药物可能为TNBC的研究提供新的思路.