基于网络药理学及生物信息学研究骨碎补-淫羊藿治疗骨质疏松的作用机制

• 作者: 陈锋 章晓云 陈跃平 李华南 甘斌 陈丁鹏 宋世雷 廖建钊
• 来源期刊: 中国骨质疏松杂志
• 关键词: 骨质疏松 淫羊藿 骨碎补 网络药理学 GEO数据库 分子对接
• 年，卷（期）: 2021,（5）
• 所属期刊栏目: 药物研究
• 页码范围: 727-734
• 页数: 8页
• 分类号: R274.9|R285.6
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-7108.2021.05.021

摘要

目的 基于网络药理学和生物信息学探讨"骨碎补-淫羊藿"治疗骨质疏松的分子机制,为骨质疏松治疗提供新的靶点.方法 通过TCMSP数据库筛选"骨碎补-淫羊藿"的活性成分,联合UniProt数据库预测其调控靶点,并根据GEO数据库预测治疗骨质疏松的靶点.借助R语言获取治疗骨质疏松的有效靶点,并构建"药物-成分-靶点-通路"网络.利用Cytoscape软件构建蛋白互作网络,并对关键活性成分与关键靶点之间进行分子对接验证,利用DAVID数据库对交集基因进行GO和KEGG分析.结果 得到活性成分39个,治疗靶点17个.蛋白互作网络中的核心靶点主要有ESR1、PRKDC、HSPA8、EP300和HSP90AA1.DAVID富集分析主要涵盖异源代谢、固醇代谢及破骨细胞分化调控等生物学过程,涉及MAPK、NF-κB、PI3K-AKT及HIF-1等信号通路.结论 通过网络药理学和生物信息学对"骨碎补-淫羊藿"治疗骨质疏松的分析不仅能识别目前已知的相关生物学过程和信号通路,还可为进一步研究"骨碎补-淫羊藿"治疗骨质疏松的药效物质基础及作用靶点提供参考.