天山棱子芹的DNA条形码分子鉴定

• 作者: 朱金芳 张平 胡江兰 阿吉艾克拜尔·艾萨
• 来源期刊: 新疆医科大学学报
• 关键词: 天山棱子芹 DNA条形码 分子鉴定 ITS2
• 年，卷（期）: 2021,（8）
• 所属期刊栏目: 药学研究|Pharmaceutical Research
• 页码范围: 948-952
• 页数: 5页
• 分类号: R931.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3639/j.issn.1009-5551.2021.08.016

摘要

目的 应用DNA条形码技术对采集的天山棱子芹样本基原进行分子鉴定.方法 提取样品总DNA并以ITS2扩增序列为主,psbA-trnH扩增序列为参考,对天山棱子芹样本DNA进行扩增,通过琼脂糖凝胶电泳检测总DNA及引物扩增结果,并进行测序.将两引物扩增成功并测序后的序列导入美国国立生物技术信息中心(national center of biotechnology information,NCBI)数据库比对,并对样本ITS2序列及其同科属植物序列进行NJ树聚类分析,再结合形态学特征推断天山棱子芹样本的基原.结果 总DNA提取成功,ITS2引物及psbA-trnH引物均扩增成功.NCBI数据库比对结果显示,样本ITS2序列与伞形科棱子芹属天山棱子芹(Hymenidium nanum)的相似度(98.2％)高于ps?bA-trnH序列与瘤果芹属裂苞瘤果芹(Trachydium involucellatum)的相似度(93.92％);NJ树聚类分析结果显示,样本与天山棱子芹聚为一支,支持率为92％;形态学特征比对结果表明,样本与天山棱子芹形态特征吻合.结论 综合传统的形态学与现代DNA条形码鉴定结果,最终确定样本的基原为天山棱子芹.