基于网络药理学和分子对接技术探讨糖足1号方治疗糖尿病足的机制

• 作者: 陈盛业 甘宇
• 来源期刊: 浙江中医药大学学报
• 关键词: 糖足1号方 糖尿病足 网络药理学 化学成分 信号通路 IL-6 IL-1β 作用机制
• 年，卷（期）: 2021,（7）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 765-777
• 页数: 13页
• 分类号: R288
• 语种: 中文
• DOI: 10.16466/j.issn1005-5509.2021.07.015

摘要

[目的]搜索糖足1号方的有效化学成分及对应人体的靶点基因,应用网络药理学方法分析其治疗糖尿病足(diabetic foot,DF)的机制.[方法]登录中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)数据库,搜索并记录糖足1号方中各味中药的化学活性物质及作用于人体的靶点;应用基因组注释数据库平台(genome annotation database platform,GeneCards)进行DF的靶点预测,将方-病靶点进行映射,连同化学活性物质构建网络图;将共同靶点输入String数据库平台,探索靶点之间的关系,寻找蛋白互作(protein protein interaction,PPI)核心基因;进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析,找出所涉及的信号通路,构建靶点-通路网络图.利用PyMoL和AutoDock软件进行分子对接,预测糖足1号方治疗DF的作用机制.验证性实验采用30只大鼠随机分为正常组、模型组、中药组,每组10只,模型组与中药组大鼠建立DF模型,造模成功后正常组与模型组不进行干预,中药组给予糖足1号方的中药外敷治疗.治疗后4周后观察比较3组大鼠白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、白细胞介素-1β(interleukin-1β,IL-1β)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(peroxisome proliferator-activated receptor gamma,PPARG)、蛋白激酶B1(protein kinase B1,AKT1)水平.[结果]筛选出糖足1号方治疗DF的关键化学成分为槲皮素、汉黄芩素、黄芩素、脱氢丹参酮ⅡA、吴茱萸次碱等共33个,并得到药物-疾病共同靶点29个;GO富集分析结果包括白细胞与细胞黏附的正调控、膜筏、细胞因子受体结合等,KEGG富集分析结果包括晚期糖基化终产物-晚期糖基化终产物受体(advanced glycation end-the receptor of advanced glycation end products,AGE-RAGE)信号通路、流体剪切应力(fluid shear stress,FSS)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)信号通路等.分子对接结果表明靶蛋白与药物关键化学成分结合较好.与正常组比较,模型组血清IL-6、IL-1β水平明显升高,创面组织中的PPARG水平明显下降,AKT1水平明显上升,差异具有统计学意义(P<0.05);与模型组比较,中药组血清IL-6、IL-1β水平显著降低,创面组织PPARG水平明显上升,AKT1水平明显下降,差异具有统计学意义(P<0.05).[结论]糖足1号方可通过多成分、多靶点、多通路的复杂作用机制发挥抗炎、抗菌、组织修复的作用,进而发挥治疗DF的作用.