猪esr基因反转录转座子插入多态性及其与大白猪生产性能的关联性分析

• 作者: 迟诚林 安亚龙 李凯媛 顾浩 王赛赛 陈才 高波 宋成义 王宵燕
• 来源期刊: 生物工程学报
• 关键词: 猪 雌激素受体 反转录转座子 反转录转座子插入多态 关联分析
• 年，卷（期）: 2021,（8）
• 所属期刊栏目: 动物及兽医生物技术|Animal and Veterinary Biotechnology
• 页码范围: 2794-2802
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13345/j.cjb.200670

摘要

雌激素受体(Estrogen receptor,esr)介导雌激素影响相关基因表达,从而调控哺乳动物的生长和繁殖机能.为了探讨esr基因的反转录转座子多态性对猪生长性能的影响,文中应用比较基因组学和生物信息学方法,预测猪esr基因的反转录转座子插入位点,采用PCR方法验证不同品种猪中插入多态性,并将该基因型与大白猪性能进行关联分析.结果 显示,esr1和esr2基因验证后得到4个反转录转座子多态性位点,分别是位于esr1基因内含子2的esr1-SINE-RIP1、位于内含子5的esr1-LINE-RIP2和esr1-SINE-RIP3,以及位于esr2基因内含子1的esr2-LINE-RIP.其中esr1-SINE-RIP1的287 bp SINE插入对大白猪的活体背膘厚和100 kg体重背膘厚有显著影响(JP＜0.05),纯合有插入(SINE+/+)的活体背膘厚和100 kg体重背膘厚显著高于杂合有插入(SINE+/-)和无插入(SINE-/-)型.这表明esr1-SINE-RIP1位点可作为分子标记辅助选育大白猪的背膘厚性状.