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基于测序的肝细胞癌血浆外泌体微小RNA-1248的差异表达及功能分析
基于测序的肝细胞癌血浆外泌体微小RNA-1248的差异表达及功能分析
作者:
胡晓原
姚纪友
麦家洛
何凯韬
夏雨
陆敏强
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
肝细胞癌
外泌体
微小RNA
摘要:
目的:筛选血浆外泌体微小核糖核苷酸(microRNA)作为肝细胞癌(HCC)的诊断标志物,并分析候选miRNA在HCC进展中可能发挥的作用。方法:2018年10月至2019年2月收集12例于广州市第一人民医院初诊为"HCC"的患者及12例健康志愿者血浆样本,利用超速离心法收集血浆外泌体,经动态光散射法及蛋白质免疫印迹法鉴定后,提取RNA进行测序。通过定量聚合酶链反应(qPCR)验证候选外泌体miRNA差异表达量,使用 t检验分析各miRNA表达量差异。通过生物信息学方法预测候选miRNA的靶基因及可能调控的通路,分析其在HCC进展过程中发挥的作用,组间比较采用 t检验。 结果:以差异表达倍数2倍以上(Fold change>2.0或<0.5,且 P<0.05)作为标准,分别比较HCC患者术前、术后及健康志愿者血浆外泌体miRNA的差异表达结果,结合两次结果,筛选表达同时上/下调miRNA共12个。其中,表达上调6个(miR-2115-3p、miR-214-3p、miR-511-5p、miR-1299、miR-10a-5p、miR-375-3p),表达下调6个(miR-219a-2-3p、miR-127-3p、miR-9-5p、miR-383-5p、miR-212-5p、miR-1248)。qPCR验证候选miRNA在HCC患者及健康志愿者血浆外泌体中的表达差异,HCC组miR-1248表达低于健康志愿者组(9.046 ΔCt比7.597 ΔCt, t=2.849, P<0.05)。 结论:血浆外泌体miR-1248有作为HCC的诊断标志物的潜力。血浆外泌体miR-1248可通过调控受体细胞的细胞外基质受体相互作用、介导代谢重编程抑制HCC进展。
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篇名
基于测序的肝细胞癌血浆外泌体微小RNA-1248的差异表达及功能分析
来源期刊
中华实验外科杂志
学科
关键词
肝细胞癌
外泌体
微小RNA
年,卷(期)
2021,(9)
所属期刊栏目
实验研究
研究方向
页码范围
1704-1707
页数
4页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.3760/cma.j.cn421213-20201020-00771
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外泌体
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中华实验外科杂志
主办单位:
中华医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1001-9030
CN:
42-1213/R
开本:
大16开
出版地:
武汉市东湖路165号
邮发代号:
38-85
创刊时间:
1984
语种:
chi
出版文献量(篇)
17168
总下载数(次)
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总被引数(次)
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